本郷三丁目駅から1km以内の内科・総合を、駅の代表点からの直線距離の近い順に並べています（まちホームの掲載分）。
- 文京区本郷・本郷三丁目のやおさか皮フ科クリニック約30m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷2-40-18｜営業時間あり
- 本郷駅前クリニック約40m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷２丁目４０ 2⁻40⁻17 本郷若井ビル2F｜営業時間あり
- 本郷耳鼻咽喉科クリニック約60m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜東京都文京区本郷4-2-8フロ-ラビルディング2階｜営業時間あり
- TSURUデンタルクリニック約70m内科・総合｜本郷三丁目駅の東側｜〒113-0033 東京都文京区本郷３丁目３５−６ 大石グリーンビル 3F｜営業時間あり
- 相田医院約70m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜東京都文京区本郷2-39-13
- 本郷耳鼻咽喉科クリニック約100m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜〒113-0033 東京都文京区本郷４丁目２−８ フローラビルディング｜営業時間あり
- コーラルクリニック約100m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜東京都文京区本郷4-1-7 3F
- 本郷レディースクリニック約130m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷２丁目２７−８｜営業時間あり
- 運営会社約140m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜東京都文京区本郷2-27-20｜営業時間あり
- タツノ内科・循環器科約150m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜東京都文京区本郷5-1-16
- 本郷みみ・はな・のどクリニック約190m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷２丁目２６−８ メディカルセンタ ３F｜営業時間あり
- うえむらクリニック形成外科本郷院約190m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷２丁目２６−８ 和可奈ビル ２階｜営業時間あり
- きずを綺麗に治す、本郷三丁目駅徒歩2分・うえむらクリニック形成外科本郷院約230m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜東京都文京区本郷2-26-8｜営業時間あり
- 内視鏡の "質" にこだわる。本三クリニック約230m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜東京都文京区本郷2-26-8｜営業時間あり
- きたなかこども成長クリニック 文京区本郷 後楽園 小児科、小児内分泌内科、小児糖尿病内科、思春期内科約240m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷2-37-6｜営業時間あり
- きたなかこども成長クリニック約240m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜〒113-0033 東京都文京区本郷２丁目３７−６ 稲毛屋ビル 4階｜営業時間あり
- うすだクリニック約260m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷4-36-5｜営業時間あり
- うすだクリニック約260m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜〒113-0033 東京都文京区本郷４丁目３６−５ ネオパリエ 1F｜営業時間あり
- 寺本内科クリニック約280m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜東京都文京区本郷5-25-13
- 飯田医院約310m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷2-32-12
- CS眼科クリニック約310m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷３丁目１５−１ 5F, 8F｜営業時間あり
- 本郷獣医科病院約330m内科・総合｜本郷三丁目駅の東側｜〒113-0034 東京都文京区湯島４丁目１−２１｜営業時間あり
- 本郷メディカルクリニック約370m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜〒113-0033 東京都文京区本郷５丁目２６−４ 東京クリスタルビル ４階｜営業時間あり
- 坂口医院約410m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜〒113-0033 東京都文京区本郷４丁目９−２２｜営業時間あり
- アリビオクリニック約430m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷1-25-9
- アリビオクリニック約440m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜〒113-0033 東京都文京区本郷１丁目２５−９ 4F｜営業時間あり
- 大森医院約470m内科・総合｜本郷三丁目駅の東側｜東京都文京区湯島4-9-8
- レプタイルクリニック約480m内科・総合｜本郷三丁目駅の南側｜〒113-0033 東京都文京区本郷３丁目２−３ 森島ビル 2F｜営業時間あり
- 本郷鐙坂医院約480m内科・総合｜本郷三丁目駅の西側｜東京都文京区本郷4-11-2
- 石川クリニック約480m内科・総合｜本郷三丁目駅の北側｜東京都文京区本郷5-29-12 103
本郷三丁目駅周辺のほかの病院
駅・路線の出典：国土数値情報（鉄道データ）（国土交通省・CC BY 4.0）駅・路線・駅コード・線路の形を加工して作成（隣の駅は線路の形から計算）／Wikidata（Wikimedia Foundation・CC0）駅名の読み・英語表記（URL の作成に使用）。お店・施設はまちホームの掲載情報です。距離は駅の代表点からの直線距離で、歩く道のりではありません。